法律主观：

公司注销后，凭证可以移交给终止单位的业务主管部门或财产所有者代管或移交有关档案馆代管。不可以擅自销毁。《会计档案管理办法》（财会字（1998）32号）第十三条规定，单位因撤销、解散、破产或者其他原因而终止的，在终止和办理注销登记手续之前形成的会计档案，应当由终止单位的业务主管部门或财产所有者代管或移交有关档案馆代管。法律、行政法规另有规定的，从其规定。

法律客观：

一、分公司注销的账务处理1、分公司不具备独立法人资格，其所有对外的债权债务均应由总公司承担。但一般分公司都是相对独立开展业务，在注销时应由总公司对其进行清算，并接收其资产、债权和未了结的债务。通过清算形成清算报表，确认盈亏，并报当地主管税务机关认可，总公司据此作相应的账务处理。2、总公司按合并报表的方式，以其净资产（亏损额）与总公司账面的拨款相抵并确认亏损。同时应将应承接的债权、债务一并并入总公司账内。3、在确认亏损时涉及总、分公司的所得税问题，应多与税务联系（特别是总公司）二、分公司注销流程是怎样的1、公司撤销或者公司决定撤销分公司的，应当自撤销决定作出之日起30日内向该分公司的公司登记机关申请注销登记。2、注销国、地税税务登记证，需要国、地税税务登记证、所有国、地税有关材料和备案公章。3、自做出注销决定之日起15日内成立清算组，公司备案申请表（公司清算组负责人签署）、指定代表或者共同委托代理人的证明（加盖公司公章）、股东会关于成立清算组的决议（全体股东签署）喝公司营业执照副本复印件。4、清算组自成立之日起10日内通知债权人，保障债权人的合法债务得到履行。5、刊登注销公告，于60日内在报纸上至少公告三次。6、清偿分公司债务，到税务部门办理完税证明。7、填写注销登记申请书，提交登记文件、证件，按约定日期领取核准通知书，注销基本账户，包括公司营业执照正本（有些银行要工商、代码、国税、地税全套证件）、开户许可证、印鉴卡、印鉴卡上预留印鉴、支票本、电汇凭证等银行相关材料和销户申请书。三、分公司注销需要备案吗1、分公司注销需要备案，分支机构注销税务登记后15日内，总机构应将分支机构注销情况报所在地主管税务机关备案，并办理变更税务登记。准备注销登记的相关材料，由所属公司做出决定并签署。材料应当提交原件，提交复印件的，应当注明“与原件一致”并由公司加盖公章。材料准备完成后，向工商登记机关提交，如果材料符合规定，则注销登记在2个工作日内就可以完成。2、分公司注销登记核准后，公司持《分公司注销登记核准通知书》到公司登记机关进行分公司撤销备案。与此同时，也要到技术监督局注销企业代码证。